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癌癥新生抗原鑒定
作者:科肽生物發表時間:2021-12-21瀏覽量:204
癌癥新生抗原鑒定
通過乳腺癌的基因組分析所證實癌癥的突變景觀是復雜的,黑色素瘤[,肝癌和許多其他主要的癌癥類型。下一代測序(NGS)技術的進步已經實現了腫瘤序列與正常序列之間快速,經濟高效的比較,這是癌癥新抗原鑒定的起點(圖1)。
圖1新抗原疫苗的設計與制造
DNA測序檢測到的許多體細胞突變均未表達(即非編碼突變,無義突變或單等位基因表達)。對于那些表達的突變導致氨基酸序列改變,異常氨基酸序列必須成功翻譯,然后加工成短肽片段,并在MHC分子的背景下展示在細胞表面上,以便被免疫系統識別??乖奶幚砗统蔬f是一個復雜的過程,涉及多個步驟,可能會影響新抗原的呈遞。MHC I類和II類分子的抗原加工過程不同。MHC I類分子呈現內源產生或由專業抗原呈遞細胞獲得的8-10個氨基酸肽。MHC II類分子呈現出更長的肽(11-20個氨基酸),這些肽來自外源蛋白質。因此,預測體細胞突變是否會產生新抗原取決于以下幾個關鍵因素:(i)體細胞突變是否在蛋白質水平表達;(ii)突變蛋白是否可以天然加工成合適的肽用于呈遞,( iii)突變體肽與患者自身MHC分子的結合親和力;以及(iv)突變體肽/ MHC復合體與響應性T細胞的TCR的親和力。更多內容請查看原文獻。
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